Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sdr16c6Q05A13 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sdr16c6Q05A13 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150 ms