Protein–RNA interactions for Protein: P97789

Xrn1, 5'-3' exoribonuclease 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,719 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn1P97789 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Xrn1P97789 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Xrn1P97789 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Xrn1P97789 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Xrn1P97789 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Xrn1P97789 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Xrn1P97789 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Xrn1P97789 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Xrn1P97789 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Xrn1P97789 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Xrn1P97789 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Xrn1P97789 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Xrn1P97789 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Xrn1P97789 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
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