Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psme1P97371 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psme1P97371 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psme1P97371 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psme1P97371 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psme1P97371 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Psme1P97371 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psme1P97371 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psme1P97371 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psme1P97371 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psme1P97371 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psme1P97371 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Psme1P97371 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Psme1P97371 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Psme1P97371 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psme1P97371 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psme1P97371 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms