Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm5cP41230 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm5cP41230 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm5cP41230 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm5cP41230 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm5cP41230 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm5cP41230 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm5cP41230 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm5cP41230 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm5cP41230 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm5cP41230 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm5cP41230 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm5cP41230 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm5cP41230 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm5cP41230 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm5cP41230 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm5cP41230 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm5cP41230 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm5cP41230 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm5cP41230 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm5cP41230 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kdm5cP41230 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm5cP41230 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms