Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RhoP15409 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RhoP15409 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RhoP15409 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RhoP15409 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RhoP15409 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RhoP15409 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RhoP15409 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RhoP15409 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RhoP15409 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RhoP15409 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RhoP15409 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RhoP15409 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RhoP15409 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RhoP15409 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RhoP15409 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RhoP15409 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RhoP15409 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RhoP15409 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RhoP15409 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RhoP15409 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RhoP15409 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RhoP15409 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RhoP15409 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RhoP15409 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RhoP15409 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RhoP15409 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RhoP15409 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RhoP15409 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhoP15409 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhoP15409 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhoP15409 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhoP15409 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhoP15409 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhoP15409 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhoP15409 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhoP15409 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhoP15409 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhoP15409 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhoP15409 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhoP15409 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhoP15409 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhoP15409 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhoP15409 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhoP15409 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RhoP15409 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhoP15409 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RhoP15409 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhoP15409 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhoP15409 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhoP15409 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhoP15409 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhoP15409 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhoP15409 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhoP15409 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhoP15409 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhoP15409 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhoP15409 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhoP15409 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhoP15409 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhoP15409 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhoP15409 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhoP15409 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhoP15409 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhoP15409 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhoP15409 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RhoP15409 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RhoP15409 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RhoP15409 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RhoP15409 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RhoP15409 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RhoP15409 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RhoP15409 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RhoP15409 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RhoP15409 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RhoP15409 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RhoP15409 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RhoP15409 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RhoP15409 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RhoP15409 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RhoP15409 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RhoP15409 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RhoP15409 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RhoP15409 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RhoP15409 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RhoP15409 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RhoP15409 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RhoP15409 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RhoP15409 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RhoP15409 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RhoP15409 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RhoP15409 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RhoP15409 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RhoP15409 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RhoP15409 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RhoP15409 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RhoP15409 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RhoP15409 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RhoP15409 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RhoP15409 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms