Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2f6O54917 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2f6O54917 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2f6O54917 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2f6O54917 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2f6O54917 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f6O54917 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f6O54917 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f6O54917 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f6O54917 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms