Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efna3O08545 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Efna3O08545 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efna3O08545 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Efna3O08545 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Efna3O08545 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Efna3O08545 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Efna3O08545 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efna3O08545 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efna3O08545 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.1 ms