Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rfx7F8VPJ6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rfx7F8VPJ6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rfx7F8VPJ6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rfx7F8VPJ6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rfx7F8VPJ6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rfx7F8VPJ6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rfx7F8VPJ6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rfx7F8VPJ6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rfx7F8VPJ6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rfx7F8VPJ6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rfx7F8VPJ6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rfx7F8VPJ6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rfx7F8VPJ6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rfx7F8VPJ6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rfx7F8VPJ6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rfx7F8VPJ6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rfx7F8VPJ6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rfx7F8VPJ6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rfx7F8VPJ6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rfx7F8VPJ6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rfx7F8VPJ6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rfx7F8VPJ6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rfx7F8VPJ6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rfx7F8VPJ6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms