Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

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Length 148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl27Q99N92 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl27Q99N92 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl27Q99N92 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Mrpl27Q99N92 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Mrpl27Q99N92 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Mrpl27Q99N92 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Mrpl27Q99N92 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Mrpl27Q99N92 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Mrpl27Q99N92 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl27Q99N92 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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