Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gps1Q99LD4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms