Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Knl1Q66JQ7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Knl1Q66JQ7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms