Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kif3aP28741 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms