Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prf1P10820 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prf1P10820 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prf1P10820 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Prf1P10820 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Prf1P10820 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prf1P10820 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prf1P10820 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prf1P10820 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms