Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb3P09026 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb3P09026 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms