Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
E2f6O54917 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2f6O54917 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2f6O54917 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2f6O54917 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2f6O54917 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2f6O54917 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2f6O54917 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2f6O54917 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2f6O54917 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
E2f6O54917 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2f6O54917 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
E2f6O54917 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms