Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trappc8E9PWG2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trappc8E9PWG2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms