Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms