Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt71Q9R0H5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms