Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Edf1Q9JMG1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Edf1Q9JMG1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms