Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 59 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smco4Q9JIS3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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