Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Irx6Q9ER75 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irx6Q9ER75 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms