Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc30Q8BVF4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms