Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam228bQ497Q6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms