Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pfdn6Q03958 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pfdn6Q03958 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pfdn6Q03958 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pfdn6Q03958 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pfdn6Q03958 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pfdn6Q03958 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pfdn6Q03958 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pfdn6Q03958 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pfdn6Q03958 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pfdn6Q03958 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pfdn6Q03958 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Pfdn6Q03958 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pfdn6Q03958 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pfdn6Q03958 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Pfdn6Q03958 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pfdn6Q03958 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pfdn6Q03958 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pfdn6Q03958 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pfdn6Q03958 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms