Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prf1P10820 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prf1P10820 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prf1P10820 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prf1P10820 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Prf1P10820 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Prf1P10820 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prf1P10820 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prf1P10820 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prf1P10820 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prf1P10820 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.6 ms