Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bbip1J3QMK2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbip1J3QMK2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms