Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col9a3A2ACT7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms