Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpc1Q9QZF2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gpc1Q9QZF2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gpc1Q9QZF2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gpc1Q9QZF2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gpc1Q9QZF2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpc1Q9QZF2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpc1Q9QZF2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpc1Q9QZF2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpc1Q9QZF2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpc1Q9QZF2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpc1Q9QZF2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpc1Q9QZF2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpc1Q9QZF2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Gpc1Q9QZF2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpc1Q9QZF2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpc1Q9QZF2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpc1Q9QZF2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpc1Q9QZF2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpc1Q9QZF2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpc1Q9QZF2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpc1Q9QZF2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpc1Q9QZF2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Gpc1Q9QZF2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpc1Q9QZF2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpc1Q9QZF2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpc1Q9QZF2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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Gpc1Q9QZF2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpc1Q9QZF2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpc1Q9QZF2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpc1Q9QZF2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpc1Q9QZF2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpc1Q9QZF2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpc1Q9QZF2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpc1Q9QZF2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpc1Q9QZF2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpc1Q9QZF2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpc1Q9QZF2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpc1Q9QZF2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpc1Q9QZF2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpc1Q9QZF2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpc1Q9QZF2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpc1Q9QZF2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpc1Q9QZF2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpc1Q9QZF2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpc1Q9QZF2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpc1Q9QZF2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpc1Q9QZF2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpc1Q9QZF2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpc1Q9QZF2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpc1Q9QZF2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpc1Q9QZF2 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms