Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.4 ms