Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5T0

Atad1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad1Q9D5T0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atad1Q9D5T0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atad1Q9D5T0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms