Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mre11Q61216 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mre11Q61216 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mre11Q61216 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mre11Q61216 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mre11Q61216 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mre11Q61216 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mre11Q61216 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mre11Q61216 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mre11Q61216 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mre11Q61216 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mre11Q61216 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mre11Q61216 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mre11Q61216 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mre11Q61216 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mre11Q61216 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mre11Q61216 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mre11Q61216 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mre11Q61216 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mre11Q61216 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mre11Q61216 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Mre11Q61216 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mre11Q61216 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mre11Q61216 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mre11Q61216 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mre11Q61216 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mre11Q61216 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mre11Q61216 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mre11Q61216 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mre11Q61216 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mre11Q61216 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mre11Q61216 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mre11Q61216 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mre11Q61216 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mre11Q61216 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mre11Q61216 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mre11Q61216 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mre11Q61216 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mre11Q61216 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mre11Q61216 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mre11Q61216 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mre11Q61216 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mre11Q61216 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mre11Q61216 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mre11Q61216 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mre11Q61216 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mre11Q61216 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mre11Q61216 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms