Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim43aQ3TL54 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim43aQ3TL54 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim43aQ3TL54 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim43aQ3TL54 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim43aQ3TL54 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim43aQ3TL54 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim43aQ3TL54 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim43aQ3TL54 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim43aQ3TL54 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim43aQ3TL54 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim43aQ3TL54 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim43aQ3TL54 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim43aQ3TL54 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim43aQ3TL54 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim43aQ3TL54 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim43aQ3TL54 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim43aQ3TL54 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim43aQ3TL54 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim43aQ3TL54 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim43aQ3TL54 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim43aQ3TL54 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim43aQ3TL54 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim43aQ3TL54 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim43aQ3TL54 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim43aQ3TL54 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim43aQ3TL54 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim43aQ3TL54 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim43aQ3TL54 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim43aQ3TL54 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim43aQ3TL54 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim43aQ3TL54 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms