Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epb41P48193 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epb41P48193 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epb41P48193 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epb41P48193 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Epb41P48193 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Epb41P48193 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms