Protein–RNA interactions for Protein: P09405

Ncl, Nucleolin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NclP09405 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NclP09405 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NclP09405 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NclP09405 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NclP09405 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NclP09405 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NclP09405 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NclP09405 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NclP09405 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NclP09405 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NclP09405 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NclP09405 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NclP09405 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NclP09405 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NclP09405 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NclP09405 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NclP09405 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NclP09405 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NclP09405 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NclP09405 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NclP09405 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NclP09405 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NclP09405 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NclP09405 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NclP09405 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NclP09405 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NclP09405 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NclP09405 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NclP09405 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NclP09405 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NclP09405 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NclP09405 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NclP09405 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NclP09405 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NclP09405 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NclP09405 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NclP09405 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NclP09405 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NclP09405 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NclP09405 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NclP09405 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NclP09405 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NclP09405 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NclP09405 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NclP09405 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NclP09405 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NclP09405 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NclP09405 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NclP09405 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NclP09405 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NclP09405 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NclP09405 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NclP09405 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NclP09405 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NclP09405 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NclP09405 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NclP09405 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NclP09405 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NclP09405 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NclP09405 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NclP09405 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NclP09405 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NclP09405 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NclP09405 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NclP09405 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NclP09405 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NclP09405 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NclP09405 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NclP09405 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NclP09405 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NclP09405 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NclP09405 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NclP09405 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NclP09405 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NclP09405 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NclP09405 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NclP09405 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NclP09405 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NclP09405 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NclP09405 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NclP09405 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NclP09405 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NclP09405 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NclP09405 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NclP09405 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NclP09405 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NclP09405 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NclP09405 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NclP09405 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NclP09405 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NclP09405 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NclP09405 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NclP09405 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NclP09405 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NclP09405 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NclP09405 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NclP09405 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NclP09405 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NclP09405 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NclP09405 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms