Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Brpf1B2RRD7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms