Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm27793-201ENSMUST00000183405 76 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm37300-201ENSMUST00000193327 280 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 A930014E01Rik-201ENSMUST00000194572 330 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm17829-201ENSMUST00000219782 344 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Mir99a-201ENSMUST00000083596 65 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Olfr355-202ENSMUST00000213574 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm24582-201ENSMUST00000103967 103 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm12351-201ENSMUST00000118727 292 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm26148-201ENSMUST00000157430 68 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm22070-201ENSMUST00000178475 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 1700112D23Rik-202ENSMUST00000193387 299 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm15235-201ENSMUST00000200572 194 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm45796-201ENSMUST00000212483 114 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 AC140344.1-201ENSMUST00000223384 387 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm25592-201ENSMUST00000082635 131 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm22443-201ENSMUST00000082890 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm43009-201ENSMUST00000199979 3566 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Cacnb4-202ENSMUST00000102760 7872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Btbd35f10-201ENSMUST00000178621 1952 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 A330044P14Rik-201ENSMUST00000176108 2706 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Olfr309-202ENSMUST00000174158 3293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm14015-201ENSMUST00000130634 3949 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Zfp950-204ENSMUST00000143264 4825 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Vmn2r48-201ENSMUST00000165611 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 AC152162.1-201ENSMUST00000225910 2917 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Zfp788-201ENSMUST00000045720 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Ugp2-202ENSMUST00000102875 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Gm14416-201ENSMUST00000118630 2308 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Gm37298-201ENSMUST00000193770 3868 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Atad1-201ENSMUST00000070210 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Fnd3c2-201ENSMUST00000091282 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Gm4736-201ENSMUST00000100870 380 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Gm14299-201ENSMUST00000117586 397 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Gm22586-201ENSMUST00000157507 122 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Mir7657-201ENSMUST00000196051 57 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Mir186-201ENSMUST00000083497 71 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Gm25684-201ENSMUST00000083941 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Vmn1r19-201ENSMUST00000089830 2255 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Ank2-208ENSMUST00000182078 14305 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Slfn9-202ENSMUST00000092840 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Fat3-205ENSMUST00000217308 18760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Cmah-206ENSMUST00000167746 9727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Spink5-201ENSMUST00000069245 4785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Vmn1r45-203ENSMUST00000227122 2861 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Vmn1r184-204ENSMUST00000227534 4807 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Gm11958-201ENSMUST00000127224 253 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Ighv1-78-201ENSMUST00000163670 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Gm29604-201ENSMUST00000187176 163 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Gm28076-201ENSMUST00000188337 410 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Macc1-203ENSMUST00000221917 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Gm25481-201ENSMUST00000083221 158 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Mir370-201ENSMUST00000083499 79 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Olfr1258-203ENSMUST00000213720 7098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Olfr869-201ENSMUST00000213024 1783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Gm25420-201ENSMUST00000104216 127 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Gm24232-201ENSMUST00000104314 132 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Gm22713-201ENSMUST00000116895 130 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Gm22850-201ENSMUST00000157714 82 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Gm22483-201ENSMUST00000157986 274 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Ighv1-77-201ENSMUST00000170551 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Gm43587-201ENSMUST00000199590 204 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Gm23727-201ENSMUST00000083352 164 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Olfr1269-203ENSMUST00000216493 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Igsf10-202ENSMUST00000193455 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Gm21037-201ENSMUST00000209086 2608 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Gm37045-201ENSMUST00000192016 2463 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Slc22a30-203ENSMUST00000120540 2598 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 AC173482.1-201ENSMUST00000224494 3815 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Zfp72-202ENSMUST00000223163 4153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Nlrp4d-201ENSMUST00000182420 2946 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Sycp2-201ENSMUST00000081134 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Olfr68-202ENSMUST00000216811 4093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Gm23772-201ENSMUST00000104433 102 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Gm12162-202ENSMUST00000129432 127 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Gm25369-201ENSMUST00000158848 132 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Gm26160-201ENSMUST00000158965 63 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Gm28992-201ENSMUST00000190534 139 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Gm44099-201ENSMUST00000203299 112 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Gm43898-201ENSMUST00000204456 424 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Gm45533-201ENSMUST00000210295 165 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 AC164100.1-201ENSMUST00000227214 508 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 AC166369.3-201ENSMUST00000227286 409 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Gm10484-201ENSMUST00000196372 4759 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Mbnl1-219ENSMUST00000194201 4319 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Olfr836-202ENSMUST00000212730 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Olfr836-203ENSMUST00000215981 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Abi3bp-202ENSMUST00000096012 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Zfp738-203ENSMUST00000137496 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Vps13d-202ENSMUST00000036579 15849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Cdc27-203ENSMUST00000106962 3160 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Ifi208-202ENSMUST00000169857 1767 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Olr1-201ENSMUST00000032265 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Vmn1r14-203ENSMUST00000227574 7394 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Gm37792-201ENSMUST00000195761 3413 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Prkdc-201ENSMUST00000023352 12647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Ghr-208ENSMUST00000161561 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rpusd2Q149F1 Gm24792-201ENSMUST00000104286 128 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 182.3 ms