Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER39

Tor1a, Torsin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tor1aQ9ER39 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tor1aQ9ER39 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tor1aQ9ER39 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tor1aQ9ER39 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tor1aQ9ER39 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tor1aQ9ER39 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tor1aQ9ER39 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tor1aQ9ER39 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tor1aQ9ER39 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tor1aQ9ER39 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tor1aQ9ER39 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tor1aQ9ER39 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tor1aQ9ER39 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tor1aQ9ER39 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tor1aQ9ER39 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Tor1aQ9ER39 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tor1aQ9ER39 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tor1aQ9ER39 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tor1aQ9ER39 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tor1aQ9ER39 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tor1aQ9ER39 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tor1aQ9ER39 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tor1aQ9ER39 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tor1aQ9ER39 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Tor1aQ9ER39 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tor1aQ9ER39 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tor1aQ9ER39 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Tor1aQ9ER39 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tor1aQ9ER39 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tor1aQ9ER39 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tor1aQ9ER39 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Tor1aQ9ER39 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tor1aQ9ER39 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Tor1aQ9ER39 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tor1aQ9ER39 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tor1aQ9ER39 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Tor1aQ9ER39 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Tor1aQ9ER39 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tor1aQ9ER39 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tor1aQ9ER39 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Tor1aQ9ER39 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Tor1aQ9ER39 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tor1aQ9ER39 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tor1aQ9ER39 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tor1aQ9ER39 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tor1aQ9ER39 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tor1aQ9ER39 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tor1aQ9ER39 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tor1aQ9ER39 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tor1aQ9ER39 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tor1aQ9ER39 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tor1aQ9ER39 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tor1aQ9ER39 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tor1aQ9ER39 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Tor1aQ9ER39 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Tor1aQ9ER39 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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