Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Subh2bvQ9D9Z7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Subh2bvQ9D9Z7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Subh2bvQ9D9Z7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Subh2bvQ9D9Z7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Subh2bvQ9D9Z7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Subh2bvQ9D9Z7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Subh2bvQ9D9Z7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms