Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gps1Q99LD4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms