Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot1Q6ZQ08 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.5 ms