Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NipblQ6KCD5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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