Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd4b4J3QNS5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd4b4J3QNS5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd4b4J3QNS5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd4b4J3QNS5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd4b4J3QNS5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd4b4J3QNS5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd4b4J3QNS5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd4b4J3QNS5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd4b4J3QNS5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd4b4J3QNS5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd4b4J3QNS5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd4b4J3QNS5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd4b4J3QNS5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd4b4J3QNS5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd4b4J3QNS5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd4b4J3QNS5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd4b4J3QNS5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd4b4J3QNS5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd4b4J3QNS5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd4b4J3QNS5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd4b4J3QNS5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd4b4J3QNS5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd4b4J3QNS5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd4b4J3QNS5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd4b4J3QNS5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd4b4J3QNS5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd4b4J3QNS5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd4b4J3QNS5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd4b4J3QNS5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd4b4J3QNS5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd4b4J3QNS5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd4b4J3QNS5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd4b4J3QNS5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd4b4J3QNS5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd4b4J3QNS5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd4b4J3QNS5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd4b4J3QNS5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd4b4J3QNS5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd4b4J3QNS5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd4b4J3QNS5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd4b4J3QNS5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd4b4J3QNS5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd4b4J3QNS5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mfsd4b4J3QNS5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms