Protein–RNA interactions for Protein: D3YX71

Gm8973, Predicted gene 8973, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8973D3YX71 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8973D3YX71 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8973D3YX71 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8973D3YX71 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8973D3YX71 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8973D3YX71 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8973D3YX71 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8973D3YX71 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8973D3YX71 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8973D3YX71 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8973D3YX71 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8973D3YX71 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8973D3YX71 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8973D3YX71 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8973D3YX71 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8973D3YX71 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8973D3YX71 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8973D3YX71 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8973D3YX71 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8973D3YX71 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8973D3YX71 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8973D3YX71 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8973D3YX71 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8973D3YX71 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8973D3YX71 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8973D3YX71 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8973D3YX71 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8973D3YX71 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8973D3YX71 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8973D3YX71 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8973D3YX71 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8973D3YX71 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8973D3YX71 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8973D3YX71 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8973D3YX71 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8973D3YX71 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8973D3YX71 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8973D3YX71 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8973D3YX71 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8973D3YX71 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm8973D3YX71 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm8973D3YX71 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm8973D3YX71 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8973D3YX71 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms