Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Col9a3A2ACT7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms