Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irx6Q9ER75 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Irx6Q9ER75 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms