Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gps1Q99LD4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gps1Q99LD4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms