Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Knl1Q66JQ7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Knl1Q66JQ7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms