Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm6Q3UZD5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm6Q3UZD5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm6Q3UZD5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm6Q3UZD5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm6Q3UZD5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm6Q3UZD5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm6Q3UZD5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm6Q3UZD5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm6Q3UZD5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm6Q3UZD5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm6Q3UZD5 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm6Q3UZD5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm6Q3UZD5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm6Q3UZD5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm6Q3UZD5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm6Q3UZD5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm6Q3UZD5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm6Q3UZD5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm6Q3UZD5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm6Q3UZD5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm6Q3UZD5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm6Q3UZD5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm6Q3UZD5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm6Q3UZD5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm6Q3UZD5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm6Q3UZD5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm6Q3UZD5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm6Q3UZD5 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm6Q3UZD5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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Prdm6Q3UZD5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm6Q3UZD5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm6Q3UZD5 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm6Q3UZD5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm6Q3UZD5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Prdm6Q3UZD5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prdm6Q3UZD5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Prdm6Q3UZD5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm6Q3UZD5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Prdm6Q3UZD5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prdm6Q3UZD5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Prdm6Q3UZD5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Prdm6Q3UZD5 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm6Q3UZD5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Prdm6Q3UZD5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Prdm6Q3UZD5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
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Prdm6Q3UZD5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Prdm6Q3UZD5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm6Q3UZD5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms