Protein–RNA interactions for Protein: Q12267

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, yeastyeast

Predictions only

Length 1,418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMC4Q12267 YNL170WYNL170W 396 nt-5.5□□□□□ -3.29
SMC4Q12267 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-5.53□□□□□ -3.29
SMC4Q12267 snR64snR64 101 nt-5.57□□□□□ -3.3
SMC4Q12267 VAR1Q0140 1197 nt-5.57□□□□□ -3.3
SMC4Q12267 YOR225WYOR225W 330 nt-5.65□□□□□ -3.31
SMC4Q12267 YLR294CYLR294C 330 nt-5.66□□□□□ -3.32
SMC4Q12267 snR62snR62 100 nt-5.7□□□□□ -3.32
SMC4Q12267 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-5.75□□□□□ -3.33
SMC4Q12267 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt-5.84□□□□□ -3.34
SMC4Q12267 snR40snR40 97 nt-5.87□□□□□ -3.35
SMC4Q12267 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-6.01□□□□□ -3.37
SMC4Q12267 snR61snR61 90 nt-6.02□□□□□ -3.37
SMC4Q12267 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt-6.13□□□□□ -3.39
SMC4Q12267 YNL338WYNL338W 159 nt-6.19□□□□□ -3.4
SMC4Q12267 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-6.28□□□□□ -3.41
SMC4Q12267 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt-6.3□□□□□ -3.42
SMC4Q12267 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt-6.46□□□□□ -3.44
SMC4Q12267 snR53snR53 91 nt-6.48□□□□□ -3.45
SMC4Q12267 Q0032Q0032 291 nt-6.58□□□□□ -3.46
SMC4Q12267 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-6.95□□□□□ -3.52
SMC4Q12267 YMR326CYMR326C 309 nt-7.1□□□□□ -3.55
SMC4Q12267 Q0144Q0144 330 nt-7.35□□□□□ -3.59
SMC4Q12267 Q0143Q0143 153 nt-7.4□□□□□ -3.59
SMC4Q12267 YHR217CYHR217C 462 nt-7.42□□□□□ -3.6
SMC4Q12267 ATP8Q0080 147 nt-8.19□□□□□ -3.72
SMC4Q12267 snR75snR75 89 nt-8.29□□□□□ -3.74
SMC4Q12267 YBL109WYBL109W 336 nt-8.33□□□□□ -3.74
SMC4Q12267 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt-8.48□□□□□ -3.77
SMC4Q12267 Q0092Q0092 141 nt-9.31□□□□□ -3.9
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 84 ms