Protein–RNA interactions for Protein: Q12215

WSC3, Cell wall integrity and stress response component 3, yeastyeast

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
WSC3Q12215 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.6□□□□□ -2.31
WSC3Q12215 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.6□□□□□ -2.31
WSC3Q12215 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.6□□□□□ -2.31
WSC3Q12215 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.6□□□□□ -2.31
WSC3Q12215 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.6□□□□□ -2.31
WSC3Q12215 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.6□□□□□ -2.31
WSC3Q12215 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.6□□□□□ -2.31
WSC3Q12215 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.6□□□□□ -2.31
WSC3Q12215 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.6□□□□□ -2.31
WSC3Q12215 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.6□□□□□ -2.31
WSC3Q12215 CDC65tQ(CUG)M 72 nt0.5□□□□□ -2.33
WSC3Q12215 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt0.5□□□□□ -2.33
WSC3Q12215 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.49□□□□□ -2.33
WSC3Q12215 snR87snR87 109 nt0.42□□□□□ -2.34
WSC3Q12215 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt0.39□□□□□ -2.35
WSC3Q12215 YOR309CYOR309C 381 nt0.14□□□□□ -2.39
WSC3Q12215 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.09□□□□□ -2.42
WSC3Q12215 snR33snR33 183 nt-0.26□□□□□ -2.45
WSC3Q12215 YNR077CYNR077C 255 nt-0.41□□□□□ -2.48
WSC3Q12215 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.42□□□□□ -2.48
WSC3Q12215 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.42□□□□□ -2.48
WSC3Q12215 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.42□□□□□ -2.48
WSC3Q12215 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-0.49□□□□□ -2.49
WSC3Q12215 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.57□□□□□ -2.5
WSC3Q12215 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-1.06□□□□□ -2.58
WSC3Q12215 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.08□□□□□ -2.58
WSC3Q12215 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-1.09□□□□□ -2.58
WSC3Q12215 YDR543CYDR543C 300 nt-1.3□□□□□ -2.62
WSC3Q12215 YJR162CYJR162C 351 nt-1.99□□□□□ -2.73
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 43.2 ms